কলকাতার সরকারি স্কুলগুলিতে মিড-ডে মিল পরিচালনার দায়িত্ব পাওয়ার পর ইসকনের রান্না করা নিরামিষ খাবারের তালিকায় প্রোটিনসমৃদ্ধ ডিম সম্পূর্ণভাবে নিষিদ্ধ হয়েছে। পাইলট প্রজেক্ট হিসেবে মুখ্যমন্ত্রী শুভেন্দু অধিকারীর সরকারের এই সিদ্ধান্তের জেরে রাজ্যজুড়ে বিতর্ক দানা বেঁধেছে। শিশুদের পুষ্টির ঘাটতি নিয়ে উদ্বেগের পাশাপাশি বিরোধী দলগুলি এই সিদ্ধান্তের পেছনে নির্দিষ্ট রাজনৈতিক উদ্দেশ্য থাকার অভিযোগ তুলেছে।

তৃণমূল কংগ্রেসের রাজ্যসভার সাংসদ ডেরেক ও’ব্রায়েনের দাবি, গুজরাতের ধাঁচে বাংলাকে নিরামিষাশী রাজ্যে পরিণত করার একটি সুকৌশল চেষ্টা চলছে। শিশুদের খাদ্যতালিকা থেকে ডিম সরিয়ে ফেলার তীব্র সমালোচনা করে তিনি বিষয়টিকে রাজনৈতিক ইন্ধন হিসেবে চিহ্নিত করেছেন। তবে ইসকন কর্তৃপক্ষের দাবি, ডিম বা মাংসের সমতুল্য প্রোটিন নিশ্চিত করতে মেনুতে সয়াবিন, পনির, রাজমা ও ডালের মতো পুষ্টিকর খাবার রাখা হচ্ছে। মুখ্যমন্ত্রী শুভেন্দু অধিকারীও এই উদ্যোগের পক্ষে অবস্থান নিয়ে জানিয়েছেন যে, খাবারের গুণগত মান বজায় রেখেই পাইলট প্রজেক্ট হিসেবে এই দায়িত্ব দেওয়া হয়েছে।